Facebook, Google en Amazon Web Services ontwikkelaars zal academici dit weekend voor een hackathon die genetische gegevens geboden door Cancer Research UK omgevormd tot een burger wetenschap smartphone spel app te zien toetreden.
Het spel, voorlopig genaamd GeneRun, kan het publiek om te zoeken naar gemeenschappelijke veranderingen in genen--veroorzaakt door een winst of verlies van chromosomen--die deel van borst kanker tumoren uitmaken te helpen verklaren welke mutaties rijden de kanker. Het idee is om crowdsource wetenschappelijk onderzoek die anders zou nemen lab werknemers jaren trawl via, en bespoediging van de gerichte drug uitvinding aanzienlijk.
"Toekomstige kankerpatiënten ontvangt behandeling gericht op de genetische vingerafdruk van hun tumor en we hopen dat dit spannende project zal voorstellen de dag die dit een realiteit wordt," zei Carlos Caldas, senior groepsleider op de Cancer Research UK Cambridge Institute, Universiteit van Cambridge. "We maken grote vooruitgang in de genetische redenen kanker ontwikkelt begrip. Maar de aanwijzingen naar waarom sommige geneesmiddelen zal werken en wat zullen niet worden gehouden in gegevens die moet worden geanalyseerd door het menselijk oog-- en dit kan het jaren duren. Door gebruik te maken van de collectieve kracht van de burger wetenschappers zal wij versnellen de ontdekking van nieuwe manieren om te diagnosticeren en behandelen van kanker veel preciezer."
Het spel--het eindproduct van een drie-daagse hack door 40 deelnemers op de Google-Campus in Oost-Londen--zal worden gehost op een platform geboden door Amazon Web Services en academici uitgenodigd naar beneden door Facebook deel (met inbegrip van sommige van de City University London) te nemen krijgen het voordeel van hun adviezen en middelen. De finale zal worden ontwikkeld door een bureau met een lancering gepland voor enige tijd deze zomer. Het hele project wordt uitgevoerd in combinatie met burger wetenschap Bondgenootschap, de organisatie achter de planeet jagers.
"Wij geloven de beste manier een probleem op te lossen is om slimme mensen samen aan 'hack' een oplossing te brengen" Philip Su, engineering site directeur van Facebook-Londen, zei. "Deze benadering is net zo goed op het gebied van de biowetenschappen, zoals het is in de software engineering. Voor ons betrokken te worden bij iets zo belangrijk als het zoeken naar behandelingen voor kanker is een grote eer en we hopen te bouwen over de ongelooflijk werk van Cancer Research UK."
Het project komt enkele maanden na het succes van CellSlider, die zag het publiek toegang tot een web-platform onregelmatige cellen van weefselmonsters gedefinieerd met een overmaat van de oestrogeen receptor proteïne, een teken van borstkanker worden geïdentificeerd. Deze keer rond, de gegevens worden verzameld van microarrays, die meten van de genexpressie. Schril veranderingen in het aantal genen kunnen relatief rechttoe-rechtaan voor een computer algoritme te herkennen, en dat is wat er nu gebeurt in de labs. Echter, identificeren precies wanneer deze wijzigingen starten en stoppen van eisen een meer subtiele, menselijke oog, en helpt bij het traceren van precies welke genen betrokken zijn in de kanker evolutie. De enige manier waarop we vindt patronen is als we gaan door deze zelfde proces voor vele, vele monsters van vele, vele patiënten--iets dat jaren duurt te doen (hoewel microarrays een snelkoppeling door analyseren duizenden monsters tegelijk bieden). Blootleggen van de genetische aarding en traject van kanker is het pad tot doelgerichte en tijdige behandeling en in mogelijke behandelingen.
Harpal Kumar, Cancer Research UK chief executive "Door gebruik te maken van de collectieve kracht van het publiek, cel schuifregelaar heeft reeds aangetoond hoe wij kan drastisch verminderen de analyse tijd voor een aantal van onze klinische proeven gegevens van achttien tot drie maanden," gewezen.
No comments:
Post a Comment